В НОУ СПО Вологодский кооперативный техникум действуют следующие подразделения:

• Администрация
• Учебная часть
• Очное отделение
• Очно-заочное отделеление
• Заочное отделение
• Библиотека
• Информационно-методический отдел
• Маркетинг-центр
• Служба по трудоустройству
• Бухгалтерия
• Технический отдел
• Хозяйственный отдел
• Учебно-производственные предприятия (кафе, закусочная, магазин, столовые)
• Общежития №1 и № 2
• Филиалы:
  • г. Череповец
  • п. Шекстна
• Представительства:
  • г. Великий Устюг
  • г. Кадуй
  • с. Липин Бор